Un file con estensione PDB è molto probabilmente un file di database del programma utilizzato per contenere le informazioni di debug su un programma o un modulo, come un file DLL o EXE. A volte vengono chiamati file di simboli.
Il file associa vari componenti e istruzioni nel codice sorgente al suo prodotto finale compilato, che il debugger può quindi utilizzare per trovare il file sorgente e la posizione nell'eseguibile in cui deve interrompere il processo di debug.
Alcuni file PDB potrebbero invece essere nel formato di file Protein Data Bank. Si tratta di file di testo semplice che memorizzano le coordinate relative alle strutture proteiche.
Altri file PDB vengono probabilmente creati nel formato di file Palm Database o PalmDOC e utilizzati con il sistema operativo mobile PalmOS; alcuni file in questo formato utilizzano invece l'estensione .PRC. Un altro possibile formato è Tanida Demo Builder.
Come aprire un file PDB
Diversi programmi utilizzano il proprio file PDB per memorizzare i dati in una sorta di formato di database strutturato, quindi ogni applicazione viene utilizzata per aprire il proprio tipo.
Geneious, Quicken, Visual Studio e Pegasus sono solo alcuni esempi di programmi che potrebbero utilizzare un file PDB come file di database. Anche Radare e PDBparse potrebbero funzionare.
Alcuni file PDB sono archiviati come testo normale, come i file del database di debug del programma Geneious, e sono completamente leggibili dall'uomo se aperti in un editor di testo. È possibile aprire questo tipo di file PDB con qualsiasi programma in grado di leggere documenti di testo, come il programma Blocco note integrato in Windows. Alcuni altri visualizzatori ed editor di file PDB includono Notepad ++ e Brackets.
Altri file PDB non sono documenti di testo e sono utili solo se aperti con il programma a cui sono destinati. Ad esempio, se il tuo è in qualche modo correlato a Quicken, prova a utilizzare quel software per visualizzarlo o modificarlo. Visual Studio prevede di visualizzare un file PDB nella stessa cartella del file DLL o EXE.
È possibile visualizzare e modificare i file PDB che sono file Protein Data Bank, in Windows, Linux e macOS con Avogadro. Anche questi programmi possono aprire il file: Jmol, RasMol, QuickPDB e USCF Chimera. Poiché si tratta di testo semplice, puoi aprirne uno anche in un editor di testo.
Palm Desktop dovrebbe essere in grado di aprire questo file se è nel formato di file del database Palm, ma potrebbe essere necessario rinominarlo per avere l'estensione file .PRC affinché il programma lo riconosca. Il calibro è un'altra opzione.
Per aprire un file PDB PalmDOC, prova STDU Viewer.
I file Tanida Demo Builder si aprono con un programma che ha lo stesso nome.
Come convertire un file PDB
I file del database di programma molto probabilmente non possono essere convertiti in un formato di file diverso, almeno non con un normale strumento di conversione di file. Se invece esiste uno strumento in grado di convertire questo tipo di file, sarebbe lo stesso programma in grado di aprirlo.
Ad esempio, se è necessario convertire il file del database da Quicken, provare a utilizzare quel programma per farlo. Questo tipo di conversione, tuttavia, probabilmente non solo è di scarsa utilità, ma non è nemmeno supportato in queste applicazioni di database (cioè, probabilmente non è necessario convertire questo tipo di file PDB in qualsiasi altro formato).
I file Protein Data Bank possono essere convertiti in altri formati con MeshLab. Per fare ciò, potresti dover prima convertirlo in WRL con PyMOL da Compila il > Salva l'immagine come > VRML menu, quindi importa il file WRL in MeshLab e utilizza l'estensione Compila il > Esporta mesh come menu per convertire infine il file PDB in STL o in un altro formato di file.
Se non hai bisogno che il modello sia a colori, puoi esportare il file direttamente in STL con USCF Chimera (il link per il download è sopra). Altrimenti, puoi utilizzare lo stesso metodo di cui sopra (con MeshLab) per convertire PDB in WRL con USCF Chimera e quindi esportare WRL in STL con MeshLab.
Per convertire PDB in PDF o EPUB, se hai un file PalmDOC, è possibile in diversi modi, ma il più semplice è probabilmente quello di utilizzare un convertitore online come Zamzar. Puoi caricare il tuo file su quel sito web per avere la possibilità di convertirlo in quei formati così come in AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT e altri formati di file eBook.
Per convertire il file PDB nel formato FASTA può essere fatto con il convertitore online da PDB a FASTA di Meiler Lab.
È anche possibile convertire questo file in CIF (formato di informazioni cristallografiche) online utilizzando PDBx / mmCIF.
Non riesci ancora ad aprire il file?
I file che non si aprono con nessuno degli strumenti dall'alto, probabilmente non sono in realtà file PDB. Quello che potrebbe succedere è che stai leggendo male l'estensione del file; alcuni formati utilizzano un suffisso che assomiglia molto a PDB quando non sono realmente correlati e non funzionano allo stesso modo.
Ad esempio, un file PDF è un file di documento, ma la maggior parte dei programmi di cui sopra non renderanno il testo e / o le immagini correttamente se si tenta di aprirne uno con questi programmi software. Lo stesso vale per altri file con estensioni di file scritte in modo simile, come file DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO e WPD.
PBD è un altro che appartiene al programma EaseUS Todo Backup ed è quindi utile solo se aperto con quel software.
Se non hai un file PDB, cerca l'estensione del file che ha il tuo file in modo da poter trovare il programma appropriato che lo apra o lo converta.
Lettura avanzata su file PDB
Puoi leggere molto di più sui file del database di programma da GitHub e Wintellect.
C'è anche altro da imparare sui file Protein Data Bank; vedere Banca dati mondiale sulle proteine e RCSB PDB.