Per creare un file IMX, seleziona File → Nuovo o fai clic su "Nuova mappa mentale" dopo aver aperto l'applicazione. Quindi scegli il tema Idea centrale e seleziona File → Salva o Salva con nome ... o fai clic sull'icona del dischetto. Una volta aperta la finestra di dialogo, assegnare un nome al file, scegliere il percorso di salvataggio e fare clic su Salva.
NOTA: i file IMX hanno sostituito .IMM file, che sono utilizzati dalla versione 4 di iMindMap e precedenti. I file IMX sono compatibili solo con iMindMap 5 e versioni successive.